Mysql启动报错：The server quit without updating PID file，解决方法

一、问题描述
某次一线报某业务网站门户登录验证码获取失败；因该验证码是代码里通过验证码函数实现存入数据库，登录时再读取数据库里的验证码来实现包包里破解登录的；因此本次故障极大可能出现在数据库服务器故障。类似报错信息如下：
polkitd[551]: Registered Authentication Agent for unix-process:3986:1469369
……
Starting MySQL. ERROR! The server quit without updating PID file (/var/run/mysqld/mysqld.pid)
环境：Mysql 5.7.20

二、故障分析处理
1）登录数据库服务器master，发现mysqld进程确实挂掉了，但是重启mysqld时，报错：The server quit without updating PID file，mysql服务启动。
2）查看日志journalctl -xe里有类似报错：

上图中：该错误表示由于未注册unix进程的身份验证代理导致服务失败，并由polkitd服务报告。错误中的 polkitd 是一个系统守护进程，在系统消息总线上提供 D-Bus 服务。只要应用程序调用服务，dbus-daemon(1) 或 systemd(1) 就会自动启动它，用户或管理员是不需要启动这个守护进程的。只要将要启动的服务加入systemd管理，即自启动的程序加入到supervisor的启动配置中，启动时就会触发该守护进程，它的身份验证代理在程序启动之前验证用户的身份，比如本次案例中的，mysqld目录的属主身份；

3）检查/var/run/mysqld/mysqld.pid文件，发现/var/run/下竟然没有mysqld目录，正常不应该的，否则上次如何启动的呢？
先/var/run/下有mysqld目录，并赋予mysql属主/组权限，否则依然无法启动。完成后重新启动mysqld，这时启动成功。

4）关于/var/run/mysqld丢失的原因
相关经验表明这是mysql5.7的一个BUG，当你停止mysql服务时,/ var/run/mysqld会被删除，且/var/run/mysqld 目录每次重启后都需要手动去创建，是因为/var/run/目录下建立文件夹是在内存中，故每次重启后内存被清空导致/var/run/mysqld 也被清除，从而导致无法启动mysql。可尝试：

1. vim /etc/init.d/mysqld
   
2. 将pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid修改为 pid-file=/var/lib/mysqld/mysqld.pid
   
3. systemctl daemon-reload
   
4. chkconfig mysqld on
   
5. service mysqld start
   

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三、附录
1）相关命令

1. mysqldump -u root -p --all-databases > /opt/mysql_db_bak/all_$(date +%F).sql
   
2. mysqladmin flush-hosts -h 172.31.71.11 -P 3306 -uroot -p
   
3. #添加mysql自启动
   
4. cp /usr/local/mysql/support-files/mysql.server /etc/init.d/mysqld
   
5. chmod +x /etc/init.d/mysqld
   
6. chkconfig --add mysqld
   
7. chkconfig --list mysqld
   
8. peeror 错误码
   

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2） mysql.server,mysqld_safe和mysqld都是可以用来启动mysql服务，他们的区别：

1、 mysql.server是以脚本的方式来启动和关闭mysql服务；它主要会用到两个程序和一个函数，分别是my_print_defaults、myslqd_safe和parse_server_arguments；其中，my_print_defaults:读取my.cnf配置文件，输出参数传递给parse_server_arguments，该程序只读my.cnf中[mysqld]中的参数。parse_server_arguments函数处理my_print_defaults传递过来的参数赋值给–basedir、–datadir、–pid-file、–service-startup-timeout等；之后mysql.server接着调用mysqld_safe这个脚本，把parse_server_arguments解析到的参数值传递到mysqld_safe的参数列表中，启动MySQL服务器；这种方式只能使用默认的/etc/my.cnf配置文件来启动mysql；

    2、mysqld_safe：它是调用mysqld程序来启动mysql服务的，my.cnf配置文件中的[mysqld_safe]部分中的参数会覆盖[mysqld]部分中的参数；mysqld进程挂掉的时候，mysqld_safe进程会监测到并重新将mysqld启动起来。即mysqld_safe可理解为是mysqld的守护进程，mysqld_safe脚本会在启动MySQL服务器后继续监控其运行情况，并在其死机时重新启动它。因此，我们启动mysql服务时，会看到启动两个进程，一个是mysqld_safe、另外一个是mysqld的服务进程，其中mysqld_safe是守护进程，如果我们要kill掉mysqld进程，需要先kill掉守护进程。

    3、mysqld：即执行/usr/local/mysql/bin/mysqld即可启动mysql服务；相关参数：–basedir=/usr/local/mysql --datadir=/usr/local/mysql/data --plugin-dir=/usr/local/mysql/lib/plugin --user=mysql --log-error=/var/log/mysqld.log

    4、mysqld_multi：当运行多个MySQL服务器进程。mysql_multi可执行文件可以对每一个服务器进程的启动或停止进行监控

3）mysql的配置文件调用顺序
    从高到低：my.cnf, $MYSQL_TCP_PORT，/etc/my.cnf，/etc/mysql/my.cnf，/usr/local/mysql/etc/my.cnf ，~/.my.cnf
    mysqld_safe指定的–defaults-file指定的新文件会覆盖默认my.cnf中的配置
    mysqld_safe指定的参数会覆盖my.cnf中的配置
    mysqld直接启动使用参数，也会覆盖my.cnf中的配置



  1、Server层：主要包括连接器、查询缓存（MySQL8.0移除）、分析器、优化器、执行器等，所有的跨存储引擎的功能都在这一层实现，比如存储过程、触发器、视图、函数等，还有一个通用的日志模块binglog

    2、存储引擎：主要负责数据的存储和读取，采用可以替换的插件式架构，支持InnoDB、MyISAM、Memory等多个存储引擎，最常用的存储引擎是InnoDB，MySQL5.5.5版本开始其被做为默认的存储引擎。
更多参看MySQL的执行原理；

5）MySQL启动检查

1. #!/bin/bash
   
2. is_start_status=`ps -ef|grep -Ew 'mysqld|mysqld_safe' | grep -vw 'grep' |  wc -l`
   
3. 
   
4. if [[ "$is_start_status" -ne 2 ]]; then
   
5.     sleep 10
   
6.     /opt/mysql/bin/mysqld_safe --defaults-file=/opt/mysql/conf/my.cnf &
   
7. fi

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